Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lims1Q99JW4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lims1Q99JW4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms