Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmd6Q99JI4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms