Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Ddb2Q99J79 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Ddb2Q99J79 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms