Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn16Q925N4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Cldn16Q925N4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cldn16Q925N4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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