Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Lmo1Q924W9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Lmo1Q924W9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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