Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Spdl1Q923A2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Spdl1Q923A2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms