Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Msi2Q920Q6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Msi2Q920Q6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms