Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Afg3l1Q920A7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Afg3l1Q920A7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Afg3l1Q920A7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Afg3l1Q920A7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms