Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps36Q91XD6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps36Q91XD6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms