Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lims2Q91XD2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms