Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Setd3Q91WC0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms