Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cabp4Q8VHC5 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cabp4Q8VHC5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms