Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Smg8Q8VE18 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg8Q8VE18 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms