Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Slc6a20aQ8VDB9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc6a20aQ8VDB9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Slc6a20aQ8VDB9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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