Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fam20bQ8VCS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Fam20bQ8VCS3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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