Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BbxQ8VBW5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms