Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cops8Q8VBV7 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms