Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc58Q8R3Q6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc58Q8R3Q6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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