Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdk8Q8R3L8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdk8Q8R3L8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms