Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K4

Ccdc137, Coiled-coil domain-containing protein 137, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc137Q8R0K4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc137Q8R0K4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc137Q8R0K4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms