Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gga1Q8R0H9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga1Q8R0H9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms