Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Hoxc12Q8K5B8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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