Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mkl1Q8K4J6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms