Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PolbQ8K409 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PolbQ8K409 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms