Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn1r188Q8K3N2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Vmn1r188Q8K3N2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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