Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prpf39Q8K2Z2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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