Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Fcho1Q8K285 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Fcho1Q8K285 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Fcho1Q8K285 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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Fcho1Q8K285 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fcho1Q8K285 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Fcho1Q8K285 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fcho1Q8K285 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms