Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pkn3Q8K045 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms