Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pnma3Q8JZW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pnma3Q8JZW8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms