Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sh2d5Q8JZW5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms