Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TwnkQ8CIW5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwnkQ8CIW5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms