Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ClasrpQ8CFC7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ClasrpQ8CFC7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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