Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc17Q8CE13 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms