Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDS7

Uncharacterized protein C21orf140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CDS7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Q8CDS7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Q8CDS7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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