Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc87Q8CDL9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc87Q8CDL9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms