Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCC3

Uncharacterized protein C12orf56 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CCC3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8CCC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8CCC3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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