Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC96

Uncharacterized protein C6orf222 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CC96 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8CC96 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8CC96 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q8CC96 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q8CC96 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Q8CC96 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q8CC96 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Q8CC96 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8CC96 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms