Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fbxo48Q8CAT8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms