Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dclre1bQ8C7W7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms