Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Nlrp4bQ8C6J9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nlrp4bQ8C6J9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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