Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Ccdc113Q8C5T8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc113Q8C5T8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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