Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sfrp1Q8C4U3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sfrp1Q8C4U3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms