Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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FarsaQ8C0C7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FarsaQ8C0C7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
FarsaQ8C0C7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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FarsaQ8C0C7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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