Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fam53cQ8BXQ8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Fam53cQ8BXQ8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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