Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Iffo1Q8BXL9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Iffo1Q8BXL9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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