Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Ube3dQ8BX13 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ube3dQ8BX13 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ube3dQ8BX13 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ube3dQ8BX13 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ube3dQ8BX13 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Ube3dQ8BX13 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ube3dQ8BX13 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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