Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snx17Q8BVL3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx17Q8BVL3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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