Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grik4Q8BMF5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms