Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLH7

Hirip3, HIRA-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hirip3Q8BLH7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hirip3Q8BLH7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hirip3Q8BLH7 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms