Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cyp4f39Q8BGU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms